【疯狂7月】⑦—免费在线小工具-突变分析系列:突变信息摘要图 | 云平台
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前言
昨天我们介绍了一个对突变信息进行统计的小工具(免费在线小工具-突变分析系列:突变注释信息汇总),除了表格外,如果能进一步对其可视化展示,更能帮助我们直观的了解数据分布。
输入数据格式说明
图片意义解读
①:突变分类统计。从突变造成的影响对其进行分析,如有义突变、无义突变、移码突变等。
②:突变类型统计。SNP-单核苷酸多态性;INS-插入突变;DEL-缺失突变。
③:单核苷酸多态性突变的细分统计。
④:所有样品的突变数量和比例。
⑤:不同突变类型的数量。
⑥:突变数量最多的基因。
参数说明
详细信息:默认绘制详细信息,若不勾选,则绘制上述④和⑤。
“SNV Class”显示内容:绘制原始计数还是比例。作用对象是第三幅图。
对Y轴做log处理:若您的数据分布范围较大,可对Y轴做log处理,使得数据可以在一张图中较为清晰地呈现。
添加横线:决定了第四幅图中横线的位置。
显示样本名:显示第四幅图中的样本名,若样本较多,可以使用下一个参数调整字号。
字号设置
显示的top基因的个数:控制第6幅图所显示的基因个数。
拓展分析
此汇总信息对我们来说肯定是不够的,分析完成后,会自动跳出侧边栏,点击可直接进行下游分析,无需重新上传文件:
如我们点击一个【瀑布图】分析,在弹框中点击跳转:
跳转后会提示文件传送成功,背景中的图片就是用您的文件进行绘制的结果(而不是示例数据啦)
更方便的是,在此分析完成后,您可以继续跳转完成其他拓展分析:
其他拓展分析我们会在继续发文进行介绍,欢迎关注本公众号获取更多信息:
云工具
地址:https://www.omicstudio.cn/tool/72
参考资料
http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/maftools/inst/doc/maftools.html
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【疯狂7月】①—免费在线小工具:fasta序列提取 | 云平台
【疯狂7月】③—免费在线小工具:表格ID信息去重 | 云平台
【疯狂7月】⑥—免费在线小工具-突变分析系列:突变注释信息汇总 | 云平台
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